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您好，相比较南京工业大学和北京印刷学院，个人偏向南京工业大学印刷工程学科评估。
1）南京工业大学是一所位于江苏省南京市的省属高校印刷工程学科评估，其前身是原南京化工大学合并了南京建筑工程学院后更名的本科高校；
2）北京印刷学院是一所位于北京市的市属高校印刷工程学科评估，也是全国唯一一所以印刷为主干学科的本科高校；
但由于印刷本身是以机械和化工为主，而南京工业大学的前身就是南京化工大学，所以在化工上，南京工业大学并不比北京印刷学院差印刷工程学科评估。
根据教育部第四轮学科评估报考来看：
1）南京工业大学有1*个学科入围：其中工学学门下属学科共12个印刷工程学科评估，管理学学门下属学科共2个，理学学门下属学科共1个，医学学门下数学科共1个；
2）北京印刷学院有*个学科入围：其中工学学门下数学科共1个，人文社科类共1个，艺术学共2个印刷工程学科评估。
北京印刷学院入围较好的是（材料科学与工程），C-等级；而南京工业大学的材料科学与工程是 B+等级，化学是C等级印刷工程学科评估。
所以院校综合实力来说，南京工业大学较好，以化工和材料学科来看，南京工业大学也较好印刷工程学科评估。北京印刷学院的设计学和美术学较好。
假如您报读的专业属于艺术学类专业，那么北京印刷学院可能有优势，其他专业可能南京工业大学更有优势印刷工程学科评估。
备注：教育部拥有其第四轮学科评估报考的最终解释权，所提供数据和分析仅供参考印刷工程学科评估。