InDesign在输出适用于印刷的PDF文件时候应该按这样步骤设置：
打开软件，在菜单的文件--Adobe PDF预设--定义
在跳出的对话框中选择新建;
在新跳出的对话框中，先给预设值起一个名称，比如：印刷输出;
预设设置共有2个选项,分别是常规 压缩 标记和出血 输出 高级 小结;
常规选项用默认值;
压缩选项中，分别对彩色图像 灰度图像 单色图像进行设置，分别把这3处的压缩修改成ZIP模式,其他处用默认值;
标记和出血设置，标记方面，根据情况，如果是书刊，需要拼版，就不需要标记了，拼完版后才会打标记，出血方面，需要把使用文档出血设置打上勾;
输出 高级 小结都用默认值；
点确定，保存；
在文件--导出，跳出对话框，保存类型选择AdobePDF(印刷)，点确定，跳出的对话框中选择刚才的预设文件