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由主工具栏，用户项目工具栏，模板标签，符号标签，颜色管理和方程式剪辑段管理器组成。
如果使用MathMagic Pro 版并在Adobe InDesign 内加入一个MathMagic 插件，当启动 InDesign CS 后你会在工具箱内看到数学工具的图标，并在主菜单条上将增加一个“插件”选项。你应该首先选择数学/预置...，在插件预置对话框内单击“查找”来定位你已安装的MathMagic Pro 版本，这样每当你选中工具箱内的数学工具并在 InDesign 的文档上拖出文本框时，便可自动启动MathMagic Pro 版本。
在MathMaic Pro 版本内，你可以创建各类的数学方程式，并选择文件菜单内的“存储到 InDesign”选项，这时你可在 InDesign 文档内看到该方程式，在视图/显示性能/高质量显示下可产生非常平滑的方程式。当你想修改该方程式时，只需双击它或在插件/数学/编辑方程式即可启动 MathMagic Pro 版本进行修改。