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InDel(insertion-deletion)插入缺失标记，指的是两种亲本中在全基因组中的差异，相对另一个亲本而言，其中一个亲本的基因组中有一定数量的核苷酸插入或缺失(Janderetal.,2002)。根据基因组中插入缺失位点，设计一些扩增这些插入缺失位点的PCR引物，这就是InDel标记。CAPS标记：基于SNP的PCR技术与RFLP技术结合的分子标记技术，简单理解就是某SNP恰好位于酶切位点上，通过对该SNP位点设计引物，经PCR后获得的相应产物片段经酶切、电泳等步骤，最终通过观察不同的条带判断样本的多态性。/来源网络